بررسی تنوع ژنتیکی برخی از توده¬های محلی طالبی ایرانی با استفاده از نشانگرهای مولکولی ریزماهواره
نویسندگان
چکیده
در این بررسی تنوع ژنتیکی بین 41 توده محلی طالبی (cucumis melo l.) به همراه دو رقم خربزه (cucumis sativus l.) از طریق تنوع در توالیهای تکراری کوتاه با استفاده از 12 جفت آغازگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. دی ان آی ژنومی استخراج شده از نمونههای گیاهی با این آغازگرها تکثیر و محصولات حاصل با استفاده از ژل پلی اکریل آمید واسرشته ساز الکتروفورز شدند. در هفت توده مکانهای ژنی سه یا چهار باندی مشاهده شد و احتمال میرود که این تودهها پلیپلوئید باشند. تعداد کل 98 آلل با متوسط 9/4 آلل به ازا هر ترکیب آغازگری شناسایی شدند. فواصل ژنتیکی میان ژنوتیپها از صفر تا 76/0 متغیر بود. میانگین فاصله ژنتیکی (بر حسب ضریب تشابه نی) در میان ژنوتیپ ها 219/0 بود. میانگین محتوای اطلاعات چندشکلی برای مکانهای ژنی تکثیر شده 542/0 بود. بیشترین میزان محتوای اطلاعات چند شکلی مربوط به cmct134b و معادل 7716/0 بود، مکانهای ژنی cmtc168، cmbr43 و cmat141 بیشترین مقدار pic (محتوای اطلاعات چندشکلی) را بهخود اختصاص داده بودند از مکانهای ژنی با میزان pic بالا میتوان برای بررسیهای بعدی استفاده کرد. روابط ژنتیکی بین تودههای مورد ارزیابی با استفاده از تجزیه خوشهای بهروش upgma بر اساس ماتریس ضرایب تشابه مورد بررسی قرار گرفت. آنالیز خوشهبندی، تودهها را به 11 گروه عمده تقسیم کرد. در دندروگرام تنوع ژنتیکی طالبیهای ایرانی در گروههایی متفاوت از رقمهای خارجی، خصوصاً فرانسوی قرار گرفتند که تایید کننده تفاوت زیاد طالبیهای ایران با آنها میباشد. بیشترین تفاوت بین ژنوتیپهای محلی داراب و آمریکایی و برابر 76 درصد بود. رابطه قابل توجهی بین تنوع ژنتیکی و جغرافیایی مشاهده نشد، با اینحال در داخل خوشهها (گروهها) و بهخصوص درگروه 2 در این زمینه ارتباطاتی دیده شد. تودههای تتراپلوئید احتمالی عمدتاً در گروه اول قرار گرفتند. نمودار دو بعدی (تجزیه به مولفههای اصلی) تطابق خوبی با دندروگرام تنوع ژنتیکی داشت.
منابع مشابه
بررسی تنوع ژنتیکی برخی از توده های محلی طالبی ایرانی با استفاده از نشانگرهای مولکولی ریزماهواره
در این بررسی تنوع ژنتیکی بین 41 توده محلی طالبی (cucumis melo l.) به همراه دو رقم خربزه (cucumis sativus l.) از طریق تنوع در توالیهای تکراری کوتاه با استفاده از 12 جفت آغازگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. دی ان آی ژنومی استخراج شده از نمونههای گیاهی با این آغازگرها تکثیر و محصولات حاصل با استفاده از ژل پلی اکریل آمید واسرشته ساز الکتروفورز شدند. در هفت توده مکانهای ژنی سه یا چهار باندی...
متن کاملارزیابی تنوع ژنتیکی برخی تودههای بومی گاودانه ایرانی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
The genetic diversity of 19 bitter vetch landraces (Vicia ervilia L.) from four provinces (East Azerbaijan, West Azerbaijan, Ardabil and Zanjan) of Iran was evaluated using 18 pairs of SSR primers. The extracted genomic DNA was amplified with eight pair primers and PCR products were separated on DNA sequencing gels. In this research, eight pair of SSR primers detected a total of 27 alleles...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی و روابط ارقام گندم ایرانی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
در این تحقیق به منظور بررسی شباهت ژنتیکی، تعیین فاصله ژنتیکی و روابط 21 رقم و لاین گندم ایرانی از50 جفت آغازگر ریزماهواره استفاده شد. الگوهای باندی بر اساس حضور(یک) و عدم حضور( صفر) باند امتیازدهی شدند. سپس محتوای اطلاعات چند شکلی (PIC) هر آغازگر ریزماهواره و شباهت ژنتیکی ارقام با استفاده از ضریب نی و لی محاسبه گردید. میانگین PIC برای نشانگرهای مورد بررسی 56/. بود. ارقام قدس و الوند دارای بیشتر...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی برخی تودههای گردوی بومی استان گلستان با استفاده از نشانگر مولکولی ریزماهواره
قبل از انجام هر کار اصلاحی شناخت تنوع ژنتیکی و پتانسیل ژنتیکی هر گونه گیاهی امری لازم و ضروری است و وجود تنوع ژنتیکی در کارهای اصلاحی بهعنوان یک برتری تلقی میشود. برای بررسی تنوع ژنتیکی در 96 ژنوتیپ از 5 توده طبیعی گردوی ایرانی از 11 مکان ژنی ریزماهواره استفاده شد. سیستم مارکر در مجموع توانست 77 آلل را با اندازهای بین 275-176 جفت باز شناسایی کنند. کمترین و بیشترین تعداد آلل مشاهده شده بهت...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی برخی رقمها و نژادگانهای سیب خارجی و محلی در ایران با استفاده از نشانگرهای مولکولی SSR وSRAP
بیشتر رقمهای سیب ایران با نامهای محلی نامگذاری شدهاند و بنابراین روابط ژنتیکی آنها چندان مشخص نیست. در این پژوهش بهمنظور تعیین شناسنامه ژنتیکی برخی نژادگانهای مختلف سیبهای ایران و نیز مقایسه روابط ژنتیکی آنها با رقمهای تجاری خارجی از دو نشانگر ریزماهواره SSR و SRAP استفاده شد. از بین 14 جفت آغازگر ریزماهواره بهکار رفته، 9 جفت آغازگر بهدلیل ایجاد چند شکلی مناسب، کارآمد تشخیص داده شدن...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی برخی ارقام مرکبات شمال ایران با استفاده از نشانگرهای مولکولی ریز ماهواره
چکیده در این مطالعه تنوع ژنتیکی 29 رقم مرکبات شامل ارقام پرتقال، نارنگی، نارنج، پوملو و تیپهای طبیعی با استفاده از هشت جفت آغازگر ریز ماهوارهای مورد ارزیابی قرار گرفت. DNA ژنومی استخراج شده از نمونه-های گیاهی با این آغازگرها تکثیر و محصولات حاصل با استفاده از ژل پلی اکریل آمید الکتروفورز شدند. از مجموع 97 باند امتیازدهی شده برای نشانگر ISSR، تعداد 78 باند معادل 22/80 درصد باندها چند شک...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)ناشر: دانشگاه بوعلی سینا
ISSN 1735-7446
دوره 1
شماره 1 2012
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023